| 年代 | 西暦 | 児童数 | 沿革の概要(主な出来事) |
| 明治10 | 1877 | 豊馨小学校・松韻小学校・蛍雪小学校・西海小学校を設置する | |
| 18 | 1885 | 上記4校を廃して,鶏林小学校・西州小学校の2校とする | |
| 20 | 1887 | 上記2校を本島尋常小学校・本島簡易小学校・牛島簡易小学校に変更する | |
| 25 | 1892 | 本島尋常小学校を本島東尋常小学校に,本島簡易小学校を本島西尋常小学校と校名変更する | |
| 26 | 1893 | 本島中尋常小学校を置く | |
| 36 | 1903 | 本島東尋常小学校・本島西尋常小学校・本島中尋常小学校を廃し,本島尋常小学校を従来の東校に置き,分教場を西校に置く | |
| 大正3 | 1914 | 実業補習学校を設置 | |
| 5 | 1916 | 高等科を設置し,本島尋常高等学校とする 実業補習科を廃す |
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| 13 | 1924 | 牛島校を廃し,牛島分教場とする | |
| 昭和元 | 1926 | 青年訓練所を設置 | |
| 10 | 1935 | 青年訓練所を廃し,青年学校を設置 | |
| 11 | 1936 | 青年学校女子部教室新築 | |
| 16 | 1941 | 本島国民学校と改称する | |
| 22 | 1947 | 554 | 仲多度郡本島村立本島小学校と改称する 青年学校は新制本島中学校に併置 |
| 25 | 1950 | 牛島分教場を独立して,仲多度郡本島村立牛島小学校とする | |
| 29 | 1954 | 425 | 尻浜分教場校舎新築 本島村と丸亀市との合併により,丸亀市立本島小学校・丸亀市立牛島小学校となる 尻浜分教場を丸亀市立本島小学校西分校と改称する |
| 31 | 1956 | 428 | 講堂新築 牛島小学校校舎・集会場新築 校章制定 |
| 32 | 1957 | 450 | 北校舎新築 校歌制定 |
| 33 | 1958 | 南校舎新築 | |
| 35 | 1960 | 385 | 四国地区へき地教育研究大会開催(西分校) |
| 40 | 1965 | 198 | 環境整備優秀校として県教委より表彰を受ける(牛島小学校) 本島給食センター落成 |
| 42 | 1967 | 153 | 文部省よりへき地教育研究指定を受ける 牛島小学校を本島小学校へ統合する 島嶼部における学校給食文部大臣表彰を受ける |
| 43 | 1968 | 155 | 四国地区へき地教育研究大会開催(本校・西分校) |
| 54 | 1979 | 114 | 西分校を本校に統合する 生の浜・尻浜・福田地区児童はスクールバス通学 |
| 55 | 1980 | 113 | 本島給食センター新築移転 |
| 56 | 1981 | 117 | へき地集会場(体育館)改築 |
| 57 | 1982 | 110 | 「本島の歴史と文化」刊行 |
| 63 | 1988 | 47 | 本島小学校・本島中学校プール竣工 第37回全国へき地教育研究大会(第5分科会場) |
| 平成14 | 2002 | 21 | 文部科学省指定「人権教育研究大会」 大規模山林火災で本島の山林4分の1を消失 |
| 15 | 2003 | 23 | 全国人権・同和教育研究大会で本校の研究を発表 丸亀市で2学期制が正式スタート |
| 16 | 2004 | 25 | 台風16号で床上浸水等の災害を受ける |
| 20 | 2008 | 29 | 文部科学省より「輝く心育成事業」研究指定委嘱 |
| 23 | 2011 | 19 | 中国・四国地区へき地教育研究指定(2カ年) |